آیا جمله‌ی he thinks that she is dead مجهول است؟

خیر، این جمله مفعول (she) و فاعل (he) مشخصی دارد و به طور واضح بیان می‌کند که "او" فکر می‌کند "او" مرده است. بنابراین، از نظر دستوری، جمله مجهول نیست.