فرق دو جمله‌ی put her clothes on...

هیچ فرقی ندارند .در  بعضی افعال دو کلمه ای  مفعول می تواند بین دو کلمه فعل یا بعد از کلمه دوم قرار بگیرد .

هر دو به معنی " لباسهایش را بپوش"  است