تعیین هاپلوتایپ کل ژنوم با استفاده از میکروفلوییدی

دانشنامه عمومی

تعیین هاپلوتایپ  میکروفلوییدی کل ژنوم روشی برای جدا کردن فیزیکی کروموزومها از یک متافاز سلولی و مشخص نمودن هاپلوتایپ برای هر سلول است.
تعیین هاپلوتایپ کل ژنوم ، فرایند مشخص نمودن هاپلوتایپ هر فرد بر اساس  ژنوم او است. [ ۱] روش های فعلی  نسل بعدی تعیین توالی قادر به شناسایی لوکوسهای هتروزیگوت است، اما برای شناسایی پلیمورفیسمهای آللها به خوبی مطالع نشده اند.   اطلاعات هاپلوتایپ مشتمل بر درک درستی از پتانسیل عملکردی واریانتها است. هاپلوتایپها عمدتاً از طریق مقایسه با ژنوتیپ والدین و یا از نمونه های جمعیتی با استفاده از روشهای محاسباتی آماری برای تعیین ارتباط عدم تعادل پیوستگی بین نشانگرها تعیین میشود. تعیین هاپلوتایپ به صورت مستقیم  ممکن است از طریق جداسازی کروموزوم یا بخشهایی از کروموزوم باشد. اکثرروشهای بیولوژی  مولکولی، میتواند هاپلوتایپهای بخش محدودی از ژنوم را به دقت تعیین نماید. تعیین هاپلوتایپ کل ژنوم  شامل مشخص نمودن هاپلوتایپ در همه کروموزومها است.
هاپلوتایپ به بخشهایی از ژنوم گفته می شود که تمایل دارند با هم به صورت یک بخش به ارث برسند که می تواند اندازه های متفاوتی داشته باشد.
، رایندی برای شناسایی کروموزومهای همولوگ است. روشهای مورد استفاده در phasing  شامل آنالیز شجره، allele - specific PCR, linkage emulsion PCR haplotype analysis, polony PCR, sperm typing, bacterial artificial chromosome cloning, construction of somatic cell hybrids, atomic force microscopy, among others.   polony PCR[ ۲]   و رشوهای کامپیوتری مانند computational inference می باشد .  
میکروفلوییدیک اشاره به استفاده از کانالهایی با ابعاد میکرو بر روی سیستمهای میکرو الکترو مکانیکی ( MEMS ) است. [ ۳]   کانالهای  میکروفلوییدی دارای قطر 10 - 100µm بوده، که این امکان را فراهم میاورد که با حجمهای بسیار اندک کار شود.   این تکنولوژی ترکیبی از مهندسی، فیزیک، شیمی، زیست شناسی و اپتیک است که  در طی دهه های گذشته در میکرو و نانو زیست شناسی و ژنتیک و پروتئومیکس تحولات عظیمی را به وجود آورده است. ابزار  میکروفلوییدی می تواند مراحل مختلف آنالیز را با هم ترکیب نماید.   اmicroarray technology و تعیین توالی نسل بعدی  از جمله ابزارهای میکروفلوییدی است.
عکس تعیین هاپلوتایپ کل ژنوم با استفاده از میکروفلوییدی
این نوشته برگرفته از سایت ویکی پدیا می باشد، اگر نادرست یا توهین آمیز است، لطفا گزارش دهید: گزارش تخلف

پیشنهاد کاربران

بپرس