ماتریس های بلوسام ( BLOSUM ) ( ماتریس بلوک های جایگزینی ) یک ماتریس جایگزینی است که در هم ترازی توالی های پروتئینی استفاده می شود. این ماتریس ها برای امتیازدهی هم ترازی های توالی های پروتئینی که در تکامل از یکدیگر متمایز شده اند، استفاده می شود و بر مبنای هم ترازی محلی می باشند. ماتریس بلوسام برای اولین بر در مقاله ای توسط Henikoff معرفی شد. [ ۱] آنها پایگاه دادهٔ بلوک ها را برای پیدا کردن مناطق حفاظت شده در پروتئین ها پیمایش کردند ( مناطقی که در هم ترازی دنباله وقفه وجود ندارد ) و فرکانس های آمینو اسیدهای مرتبط و احتمال های جایگزینی را به دست آوردند. سپس امتیاز لوجیت هر ۲۱۰ جایگزینی ممکن بین ۲۰ پروتئین استاندارد را محاسبه نمودند. برخلاف ماتریس های PAM که بر پایه مقایسه بین پروتئین نزدیک برون یابی می شود، ماتریس های بلوسام بر پایهٔ هم ترازی های مشاهده شده ساخته شده است.
دستورالعمل های ژنتیکی هر سلول از یک موجود زنده در DNA آن ذخیره شده است. [ ۲] در طول حیات سلول، این اطلاعات برای تولید پروتئین یا برای تقسیم سلولی رونویسی می شوند و احتمال آن وجود دارد که این محتویات در حین این فرایندها دستخوش تغییر شوند. [ ۲] [ ۳] این تغییر به عنوان جهش شناخته شده است. در سطح مولکولی سیستم های تنظیم کننده ای هستند که بیشتر این جهش ها را اصلاح می کنند. [ ۳] [ ۴]
عملکرد پروتئین ها بسیار وابسته به ساختار آن ها است. [ ۵] تغییر یک آمینواسید در پروتئین ممکن است کارآمدی آن را برای انجام وظیفهٔ مربوطه کاهش یا کارکرد آن را تغییر دهد. [ ۳] تغییرات این چنینی می توانند یک عملکرد حیاتی در سلول را مختل کنند یا حتی منجر به مرگ سلول شوند. [ ۶] در مقابل، این تغییر ممکن است به سلول اجازه ادامهٔ فعالیت هرچند متفاوت را بدهدو جهش به فرزندان موجودات زنده منتقل شود. اگر این تغییر باعث ضعف جسمی قابل توجهی نشود این احتمال وجود دارد که جهش در جمعیت باقی بماند. همچنین این امکان وجود دارد که تغییر در عملکرد یک تغییر مفید باشد.
۲۰ اسید آمینه ترجمه شده توسط کد ژنتیکی تا حدود زیادی از نظر خواص فیزیکی و شیمیایی زنجیره های جانبی آنها متفاوت هستند. [ ۵] این اسیدهای آمینه می تواند به طبقه بندی به گروه های مشابه با خواص فیزیکوشیمیایی. [ ۵] جایگزین کردن یک اسید آمینه با یکی دیگر از همان دسته است بیشتر احتمال دارد به یک کوچکتر تأثیر بر ساختار و عملکرد پروتئین از جایگزینی با یک اسید آمینه از رده های مختلف.
این نوشته برگرفته از سایت ویکی پدیا می باشد، اگر نادرست یا توهین آمیز است، لطفا گزارش دهید: گزارش تخلفدستورالعمل های ژنتیکی هر سلول از یک موجود زنده در DNA آن ذخیره شده است. [ ۲] در طول حیات سلول، این اطلاعات برای تولید پروتئین یا برای تقسیم سلولی رونویسی می شوند و احتمال آن وجود دارد که این محتویات در حین این فرایندها دستخوش تغییر شوند. [ ۲] [ ۳] این تغییر به عنوان جهش شناخته شده است. در سطح مولکولی سیستم های تنظیم کننده ای هستند که بیشتر این جهش ها را اصلاح می کنند. [ ۳] [ ۴]
عملکرد پروتئین ها بسیار وابسته به ساختار آن ها است. [ ۵] تغییر یک آمینواسید در پروتئین ممکن است کارآمدی آن را برای انجام وظیفهٔ مربوطه کاهش یا کارکرد آن را تغییر دهد. [ ۳] تغییرات این چنینی می توانند یک عملکرد حیاتی در سلول را مختل کنند یا حتی منجر به مرگ سلول شوند. [ ۶] در مقابل، این تغییر ممکن است به سلول اجازه ادامهٔ فعالیت هرچند متفاوت را بدهدو جهش به فرزندان موجودات زنده منتقل شود. اگر این تغییر باعث ضعف جسمی قابل توجهی نشود این احتمال وجود دارد که جهش در جمعیت باقی بماند. همچنین این امکان وجود دارد که تغییر در عملکرد یک تغییر مفید باشد.
۲۰ اسید آمینه ترجمه شده توسط کد ژنتیکی تا حدود زیادی از نظر خواص فیزیکی و شیمیایی زنجیره های جانبی آنها متفاوت هستند. [ ۵] این اسیدهای آمینه می تواند به طبقه بندی به گروه های مشابه با خواص فیزیکوشیمیایی. [ ۵] جایگزین کردن یک اسید آمینه با یکی دیگر از همان دسته است بیشتر احتمال دارد به یک کوچکتر تأثیر بر ساختار و عملکرد پروتئین از جایگزینی با یک اسید آمینه از رده های مختلف.
wiki: بلوسام