پروژه پایگاه داده ژنوم آنسامبل. پروژه پایگاه داده ژنوم آنسامبل ( انگلیسی: Ensembl genome database project ) یک پروژه علمی در «مؤسسهٔ بیوانفورماتیک اروپا» است که در سال ۱۹۹۹ میلادی در پاسخ به تکمیل قریب الوقوع پروژه ژنوم انسان راه اندازی شد. [ ۲]
هدف پروژهٔ آنسامبل، تأمین یک منبع متمرکز برای دانشمندان علم ژنتیک، علوم سلولی - مولکولی و سایر پژوهشگرانی که ژنوم انسان، مهره داران و مدل های ارگانیسم را بررسی و مطالعه می کنند. [ ۳] آنسامبل یکی از چند مرورگر ژنوم شناخته شده و مشهور است که می توان اطلاعات ژنومیک را از آن به دست آورد. یک مرورگر و پایگاه داده در مرکز ملی اطلاعات زیست فناوری ( NCBI ) و دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز ( UCSC ) موجود است.
ژنوم انسان از ۳ میلیارد جفت باز تشکیل شده است که در حدود ۲۰٬۰۰۰ تا ۲۵٬۰۰۰ ژن را کُدگذاری می کنند. با این حال، دانستن ژنوم به تنهایی، استفاده چندانی ندارد مگر آنکه جایگاه دقیق ژن ها و رابطه شان را با هم بشناسیم. برای این منظور، یک راهکار آن است که گزارمان دستی انجام شود که طی آن، گروهی از دانشمندان با استفاده از داده های تجربی به دست آمده از مقالات علمی و پایگاه های دادهٔ عمومی، جایگاه ژن را تعیین می کنند. این روش بسیار زمان بر و طاقت فرسا است. روش دیگر آن است که با استفاده از قدرت محاسباتی کامپیوترها، گزارمان اتوماتیک انجام شود تا کارهای دشواری چون تطبیق الگو پروتئین با دی ان ای در زمان کمتر و سهولت بیشتری انجام شود.
این وبسایت، رابط برنامه نویسی کاربردی REST و Perl را در اختیار استفاده کنندگان قرار می دهد. [ ۴]
علاوه بر ژنوم انسان، ژنوم های توصیف شدهٔ برخی مدل های جانوری و مهره داران در این پایگاه داده فراهم آمده است که همگی یوکاریوت هستند. تا سال ۲۰۰۸ این موارد توصیف شده است:
• طنابداران
• پستانداران
• هونیاسنجابک سانان
• نخستی سانان: شب دوست بزرگ شمالی، شامپانزه معمولی، انسان، میمون رزوس، لمور موشی خاکستری، اورانگوتان سوماترایی، میمون شبگرد فیلیپینی؛
• حشره خواران درختی: حشره خواران درختی؛
• سنجابک سانان ( = جوندگان + خرگوش سانان ) : خوکچه هندی، خرموش کانگورویی اورد، موش خانگی، موش صحرایی قهوه ای، سنجاب زمینی پلنگی، خرگوش بی دم آمریکایی، خرگوش اروپایی؛
• حشره: مگس سرکه ( مگس میوه ) ، آنوفلس گامبی ( پشه ) ، آئدس آگیپتی ( پشه )
• کرم ها: کرم الگانس
این نوشته برگرفته از سایت ویکی پدیا می باشد، اگر نادرست یا توهین آمیز است، لطفا گزارش دهید: گزارش تخلفهدف پروژهٔ آنسامبل، تأمین یک منبع متمرکز برای دانشمندان علم ژنتیک، علوم سلولی - مولکولی و سایر پژوهشگرانی که ژنوم انسان، مهره داران و مدل های ارگانیسم را بررسی و مطالعه می کنند. [ ۳] آنسامبل یکی از چند مرورگر ژنوم شناخته شده و مشهور است که می توان اطلاعات ژنومیک را از آن به دست آورد. یک مرورگر و پایگاه داده در مرکز ملی اطلاعات زیست فناوری ( NCBI ) و دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز ( UCSC ) موجود است.
ژنوم انسان از ۳ میلیارد جفت باز تشکیل شده است که در حدود ۲۰٬۰۰۰ تا ۲۵٬۰۰۰ ژن را کُدگذاری می کنند. با این حال، دانستن ژنوم به تنهایی، استفاده چندانی ندارد مگر آنکه جایگاه دقیق ژن ها و رابطه شان را با هم بشناسیم. برای این منظور، یک راهکار آن است که گزارمان دستی انجام شود که طی آن، گروهی از دانشمندان با استفاده از داده های تجربی به دست آمده از مقالات علمی و پایگاه های دادهٔ عمومی، جایگاه ژن را تعیین می کنند. این روش بسیار زمان بر و طاقت فرسا است. روش دیگر آن است که با استفاده از قدرت محاسباتی کامپیوترها، گزارمان اتوماتیک انجام شود تا کارهای دشواری چون تطبیق الگو پروتئین با دی ان ای در زمان کمتر و سهولت بیشتری انجام شود.
این وبسایت، رابط برنامه نویسی کاربردی REST و Perl را در اختیار استفاده کنندگان قرار می دهد. [ ۴]
علاوه بر ژنوم انسان، ژنوم های توصیف شدهٔ برخی مدل های جانوری و مهره داران در این پایگاه داده فراهم آمده است که همگی یوکاریوت هستند. تا سال ۲۰۰۸ این موارد توصیف شده است:
• طنابداران
• پستانداران
• هونیاسنجابک سانان
• نخستی سانان: شب دوست بزرگ شمالی، شامپانزه معمولی، انسان، میمون رزوس، لمور موشی خاکستری، اورانگوتان سوماترایی، میمون شبگرد فیلیپینی؛
• حشره خواران درختی: حشره خواران درختی؛
• سنجابک سانان ( = جوندگان + خرگوش سانان ) : خوکچه هندی، خرموش کانگورویی اورد، موش خانگی، موش صحرایی قهوه ای، سنجاب زمینی پلنگی، خرگوش بی دم آمریکایی، خرگوش اروپایی؛
• حشره: مگس سرکه ( مگس میوه ) ، آنوفلس گامبی ( پشه ) ، آئدس آگیپتی ( پشه )
• کرم ها: کرم الگانس
