در حوزهٔ زیست مولکولی، اندازه گیری پروفایل بیان ژن معیاری از فعالیت هزاران ژن به صورت یکجا، برای ایجاد یک تصویر عمومی از کارکرد سلول است. این پروفایل می تواند برای مثال بین سلول های فعال جدا از هم تمایز ایجاد کند، یا مشخص کند یک سلول چگونه به یک درمان واکنش نشان می دهد. بسیاری از آزمایش های در این سطح، کل ژنوم را به صورت هم زمان، برای هر ژن، در یک سلول خاص اندازه گیری می کنند.
تعداد زیادی تکنولوژی ترانسکریپتوم برای تولید دادهٔ مورد نیاز برای آنالیز می تواند مورد استفاده واقع شود. ریزآرایهٔ دی اِن اِی[ ۱] فعالیت نسبی یکسری ژن هدف را اندازه می گیرد. تکنولوژی های مبتنی بر دنباله، مانند توالی یابی آران ای علاوه بر سطح بیان ژن ها، اطلاعاتی از دنبالهٔ آن ها را نیز فراهم می کنند.
به دست آوردن بیان ژن، مرحلهٔ منطقی پس از توالی یابی ژنوم است: دنبالهٔ ژنوم به ما این اطلاعات را می دهد که سلول چه فعالیت هایی انجام می دهد، در حالی که پروفایل بیان ژن مشخص می کند دقیقاً در آن لحظه چه کارهایی انجام می شود. ژن ها شامل دستورهایی هستند که آراِن اِی های پیام رسان ( mRNA ) را می سازند، اما در هر لحظه هر سلول فقط بخشی از ژن هایی که دارد را به mRNA تبدیل می کند. چنان چه ژنی، در حال تولید mRNA باشد، آن ژن «روشن» و در غیر این صورت «خاموش» در نظر گرفته می شود. معیارهای زیادی مشخص می کنند که یک ژن روشن یا خاموش باشد، از جملهٔ آن ها می توان به زمان، محیطی که در آن قرار دارد و سیگنال های شیمیایی که از سلول های دیگر دریافت می کند اشاره کرد.
بررسی پروفایل بیان ژن، معمولاً اندازهٔ نسبی بیان mRNAها را در دو یا چند شرایط آزمایشگاهی بدست می آورد. به این دلیل که تغییرهای سطح بیان یک دنبالهٔ مشخص از mRNA، تغییرهایی در پروتئین حاصل از آن ژن را نشان می دهد، که می توان نمایندهٔ یک شرایط آسیب دیده یا پاسخ هم ایستایی باشد. برای مثال سطح بیان بالای mRNA ای که الکل dehydrogenase را کد می کند نشان دهندهٔ این است که سلول ها یا بافت مورد بررسی، در حال پاسخ گویی به افزایش سطح اتانول در محیط است. [ ۲] [ ۳] [ ۴]
ژنوم انسان شامل حدود ۵۰۰۰ ژن می باشد که در حدود ۱٬۰۰۰٬۰۰۰ پروتئین متفاوت را تولید می کنند. این به خاطر پیرایش جایگزین است و همین طور به خاطر اینکه سلول ها تغییرهایی را پس از اینکه بار اول پروتئین را ایجاد کردند، در پروسهٔ پیرایش پسارونویسی ایجاد می کنند، و در نتیجه، هر ژن می تواند پایه ای برای تولید نسخه های متفاوت پروتئین باشد. با یک آزمایش mass spectrometry می توان حدود ۲۰۰۰ پروتئین یا ۰٫۲٪ از کل پروتئین ها را شناسایی کرد. [ ۵] اطلاعاتی که از خود پروتئین ها ( پروتئومیک ) بدست می آید از اطلاعاتی که از RNAهای پیام رسان استخراج می شود دقیق تر است. [ ۶]
این نوشته برگرفته از سایت ویکی پدیا می باشد، اگر نادرست یا توهین آمیز است، لطفا گزارش دهید: گزارش تخلفتعداد زیادی تکنولوژی ترانسکریپتوم برای تولید دادهٔ مورد نیاز برای آنالیز می تواند مورد استفاده واقع شود. ریزآرایهٔ دی اِن اِی[ ۱] فعالیت نسبی یکسری ژن هدف را اندازه می گیرد. تکنولوژی های مبتنی بر دنباله، مانند توالی یابی آران ای علاوه بر سطح بیان ژن ها، اطلاعاتی از دنبالهٔ آن ها را نیز فراهم می کنند.
به دست آوردن بیان ژن، مرحلهٔ منطقی پس از توالی یابی ژنوم است: دنبالهٔ ژنوم به ما این اطلاعات را می دهد که سلول چه فعالیت هایی انجام می دهد، در حالی که پروفایل بیان ژن مشخص می کند دقیقاً در آن لحظه چه کارهایی انجام می شود. ژن ها شامل دستورهایی هستند که آراِن اِی های پیام رسان ( mRNA ) را می سازند، اما در هر لحظه هر سلول فقط بخشی از ژن هایی که دارد را به mRNA تبدیل می کند. چنان چه ژنی، در حال تولید mRNA باشد، آن ژن «روشن» و در غیر این صورت «خاموش» در نظر گرفته می شود. معیارهای زیادی مشخص می کنند که یک ژن روشن یا خاموش باشد، از جملهٔ آن ها می توان به زمان، محیطی که در آن قرار دارد و سیگنال های شیمیایی که از سلول های دیگر دریافت می کند اشاره کرد.
بررسی پروفایل بیان ژن، معمولاً اندازهٔ نسبی بیان mRNAها را در دو یا چند شرایط آزمایشگاهی بدست می آورد. به این دلیل که تغییرهای سطح بیان یک دنبالهٔ مشخص از mRNA، تغییرهایی در پروتئین حاصل از آن ژن را نشان می دهد، که می توان نمایندهٔ یک شرایط آسیب دیده یا پاسخ هم ایستایی باشد. برای مثال سطح بیان بالای mRNA ای که الکل dehydrogenase را کد می کند نشان دهندهٔ این است که سلول ها یا بافت مورد بررسی، در حال پاسخ گویی به افزایش سطح اتانول در محیط است. [ ۲] [ ۳] [ ۴]
ژنوم انسان شامل حدود ۵۰۰۰ ژن می باشد که در حدود ۱٬۰۰۰٬۰۰۰ پروتئین متفاوت را تولید می کنند. این به خاطر پیرایش جایگزین است و همین طور به خاطر اینکه سلول ها تغییرهایی را پس از اینکه بار اول پروتئین را ایجاد کردند، در پروسهٔ پیرایش پسارونویسی ایجاد می کنند، و در نتیجه، هر ژن می تواند پایه ای برای تولید نسخه های متفاوت پروتئین باشد. با یک آزمایش mass spectrometry می توان حدود ۲۰۰۰ پروتئین یا ۰٫۲٪ از کل پروتئین ها را شناسایی کرد. [ ۵] اطلاعاتی که از خود پروتئین ها ( پروتئومیک ) بدست می آید از اطلاعاتی که از RNAهای پیام رسان استخراج می شود دقیق تر است. [ ۶]
wiki: پروفایل بیان ژن