هستی شناسی ژن یا آنتولوژی ژن ( به انگلیسی: Gene Ontology ) یا به صورت خلاصه GO یک پروژه گروهی در بیوانفورماتیک برای استفاده از یک نمایش و هستی شناسی واحد برای بیان ویژگی های ژن ها و محصولات ژنتیکی است. [ ۱] این پروژه اطلاعاتی ساختاریافته و قابل پردازش از عملکرد ژن ها و محصولات ژنتیکی ارائه می دهد. امروزه داده های پروژه GO به طور گسترده در علوم زیستی استفاده می شوند و محتوای آن هم از نظر کیفیت و هم از نظر کمیت مدام در حال تغییر است. [ ۲] به طور دقیق تر این پروژه تلاش می کند تا سه هدف زیر را کسب کند:[ ۳]
• از کتاب خانه ژن ها و ویژگی های هر ژن نگه داری کند و آن را توسعه دهد.
• برای ژن ها حاشیه نویسی کند و حاشیه های نوشته شده را جمع آوری و توزیع کند.
• ابزاری برای دسترسی راحت به تمام جنبه های داده های ارائه شده توسط این پروژه را در اختیار همگان قرار دهد.
پایگاه داده GO یک پایگاه داده پویاست و محققین به همراه اعضای پروژه GO به طور مداوم برروی آن تغییرات و اصلاحاتی اعمال می کنند. این تغییرات پیشنهاد شده توسط ویرایشگران GO بررسی می شوند و در صورت مناسب بودن اعمال می شوند.
داده های پروژه GO با قالب های متفاوت از طریق وبسایت GO به صورت رایگان قابل دسترسیست. همچنین می توان از مرورگر برخط GO برای دسترسی به این اطلاعات استفاده کرد. این پروژه امکان بارگیری نگاشت هایی از اصطلاحاتش به اصطلاحات معادل در سیستم های دیگر طبقه بندی را نیز فراهم کرده است.
پروژه هستی شناسی ژن به عنوان یک کنسرسیوم از سال ۱۹۹۸ آغاز به کار کرد. در آن زمان سه گروه از محققین که برروی سه مدل ارگانیسم مختلف ( مگس سرکه، موش خانگی و ساکارومایسس سرویزیه که یک نوع مخمر صنعتیست ) کار می کردند تصمیم گرفتند تا با هم کاری هم یک طبقه بندی مشترک برای کارکرد ژن ها ایجاد کنند. این پروژه به گونه ای پیشرفت کرده که امروزه ژن های چندین هزار جاندار مختلف در آن قرار گرفته اند. [ ۴]
هستی شناسی نمایشی از چیزیست که آن را می شناسیم. هستی شناسی ها شامل مجموعه ای از کلاس ها یا اصطلاحات و رابطه های میان این اصطلاحات هستند. در علوم زیستی و شاخه های مرتبط با آن، اصطلاحات معنی فراگیری ندارند و معنی هر اصطلاح توسط حوزه پژوهشی که در آن به کار می رود مشخص می شود. این مسئله باعث بروز مشکلاتی در ارتباطات و به اشتراک گذاشتن اطلاعات میان زیست شناسان می شود. پروژه هستی شناسی ژن در تلاش است تا یک هستی شناسی از اصطلاحات تعریف شده ای که خصوصیات محصولات ژنتیکی را مشخص می کنند ارائه دهد. این هستی شناسی سه محدوده اصلی را پوشش می دهد:[ ۱]
این نوشته برگرفته از سایت ویکی پدیا می باشد، اگر نادرست یا توهین آمیز است، لطفا گزارش دهید: گزارش تخلف• از کتاب خانه ژن ها و ویژگی های هر ژن نگه داری کند و آن را توسعه دهد.
• برای ژن ها حاشیه نویسی کند و حاشیه های نوشته شده را جمع آوری و توزیع کند.
• ابزاری برای دسترسی راحت به تمام جنبه های داده های ارائه شده توسط این پروژه را در اختیار همگان قرار دهد.
پایگاه داده GO یک پایگاه داده پویاست و محققین به همراه اعضای پروژه GO به طور مداوم برروی آن تغییرات و اصلاحاتی اعمال می کنند. این تغییرات پیشنهاد شده توسط ویرایشگران GO بررسی می شوند و در صورت مناسب بودن اعمال می شوند.
داده های پروژه GO با قالب های متفاوت از طریق وبسایت GO به صورت رایگان قابل دسترسیست. همچنین می توان از مرورگر برخط GO برای دسترسی به این اطلاعات استفاده کرد. این پروژه امکان بارگیری نگاشت هایی از اصطلاحاتش به اصطلاحات معادل در سیستم های دیگر طبقه بندی را نیز فراهم کرده است.
پروژه هستی شناسی ژن به عنوان یک کنسرسیوم از سال ۱۹۹۸ آغاز به کار کرد. در آن زمان سه گروه از محققین که برروی سه مدل ارگانیسم مختلف ( مگس سرکه، موش خانگی و ساکارومایسس سرویزیه که یک نوع مخمر صنعتیست ) کار می کردند تصمیم گرفتند تا با هم کاری هم یک طبقه بندی مشترک برای کارکرد ژن ها ایجاد کنند. این پروژه به گونه ای پیشرفت کرده که امروزه ژن های چندین هزار جاندار مختلف در آن قرار گرفته اند. [ ۴]
هستی شناسی نمایشی از چیزیست که آن را می شناسیم. هستی شناسی ها شامل مجموعه ای از کلاس ها یا اصطلاحات و رابطه های میان این اصطلاحات هستند. در علوم زیستی و شاخه های مرتبط با آن، اصطلاحات معنی فراگیری ندارند و معنی هر اصطلاح توسط حوزه پژوهشی که در آن به کار می رود مشخص می شود. این مسئله باعث بروز مشکلاتی در ارتباطات و به اشتراک گذاشتن اطلاعات میان زیست شناسان می شود. پروژه هستی شناسی ژن در تلاش است تا یک هستی شناسی از اصطلاحات تعریف شده ای که خصوصیات محصولات ژنتیکی را مشخص می کنند ارائه دهد. این هستی شناسی سه محدوده اصلی را پوشش می دهد:[ ۱]
wiki: هستی شناسی ژن