در زیست شناسی، مدل جایگزینی توصیف فرایند تغییر یک رشته به رشته های دیگر است برای مثال در مدل شاخه بندی هر موقعیت در دنباله نشانهٔ وجود یا عدم وجود یک خاصیت در یک نوع موجود است. الفبای این فرایند از «۰» برای نبودن و «۱» برای بودن آن خاصیت است. برای مثال ۰۰۱۱۰ یعنی، آن موجود پر ندارد و تخم نمی گذارد، پشم دارد، خون گرم است، و نمی تواند زیر آب نفس بکشد. در فیلوژنتیک دنباله ها می توانند از هم ترازی یک رشته اسیدهای نوکلئیک یا توالی پروتئین ها باشند؛ که در آن هر باز یا آمینواسید، یک کارکتر از رشته خواهند بود، برای مثال رشته می تواند AGCGGAGCTTA یا GCCGTAGACGC باشد.
مدل جایگزینی برای موارد زیر استفاده می شود:
• ساخت درختان تکاملی در فیلوژنتیک یا cladistics.
• شبیه سازی توالی برای تست سایر روش ها و الگوریتم ها.
اکثر مدل های جایگزینی که امروزه استفاده می شوند دارای خواص
طول یک شاخه از درخت فیلوژنتیک برابر امید تعداد جابجایی ها در یک جایگاه است، به عنوان مثال اگر مدل تکامل بیان کند که یک جایگاه از دنبالهٔ جد به طور میانگین پس از x جابه جایی به دنبالهٔ فرزند تبدیل می شود آنگاه فاصلهٔ جد از فرزند با شاخه ای به طول x نمایش داده می شود.
گاهی طول یک شاخه با فاصلهٔ زمین شناسی دو گونه سنجیده می شود. برای مثال یک فسیل ممکن است فاصلهٔ زمانی بین یک گونهٔ جد و یک گونهٔ فرزند را مشخص گند. به دلیل این که هر گونه با سرعت متفاوتی تکامل پیدا می کند این دو معیار ممکن است همیشه با هم نسبت مستقیم نداشته باشند. امید تعداد جابه جایی ها در یک جایگاه در هر سال با حرف یونانی میو ( μ ) نمایش داده می شود. وقتی امید تعداد جابه جایی ها در سال μ مستقل از نوع گونهٔ در حال تکامل باشد می گوییم مدل ساعت مولکولی مشخص دارد.
یکی از مهم ترین خواص ساعت مولکلی ثابت، این است که امید تعداد جابه جایی ها بین یک گونهٔ جد و تمام فرزندان حال حاضر آن مستقل از نوع گونه های فرزند مشخص می شود. [ ۱]
این نوشته برگرفته از سایت ویکی پدیا می باشد، اگر نادرست یا توهین آمیز است، لطفا گزارش دهید: گزارش تخلفمدل جایگزینی برای موارد زیر استفاده می شود:
• ساخت درختان تکاملی در فیلوژنتیک یا cladistics.
• شبیه سازی توالی برای تست سایر روش ها و الگوریتم ها.
اکثر مدل های جایگزینی که امروزه استفاده می شوند دارای خواص
طول یک شاخه از درخت فیلوژنتیک برابر امید تعداد جابجایی ها در یک جایگاه است، به عنوان مثال اگر مدل تکامل بیان کند که یک جایگاه از دنبالهٔ جد به طور میانگین پس از x جابه جایی به دنبالهٔ فرزند تبدیل می شود آنگاه فاصلهٔ جد از فرزند با شاخه ای به طول x نمایش داده می شود.
گاهی طول یک شاخه با فاصلهٔ زمین شناسی دو گونه سنجیده می شود. برای مثال یک فسیل ممکن است فاصلهٔ زمانی بین یک گونهٔ جد و یک گونهٔ فرزند را مشخص گند. به دلیل این که هر گونه با سرعت متفاوتی تکامل پیدا می کند این دو معیار ممکن است همیشه با هم نسبت مستقیم نداشته باشند. امید تعداد جابه جایی ها در یک جایگاه در هر سال با حرف یونانی میو ( μ ) نمایش داده می شود. وقتی امید تعداد جابه جایی ها در سال μ مستقل از نوع گونهٔ در حال تکامل باشد می گوییم مدل ساعت مولکولی مشخص دارد.
یکی از مهم ترین خواص ساعت مولکلی ثابت، این است که امید تعداد جابه جایی ها بین یک گونهٔ جد و تمام فرزندان حال حاضر آن مستقل از نوع گونه های فرزند مشخص می شود. [ ۱]
wiki: مدل جایگزینی