لوگوی دنباله

در بیوانفورماتیک یک لوگوی دنباله ( موتیف توالی ) یک نمایش گرافیکی از غلطت مکانی نوکلئوتید هاست در یک رشته از DNA/RNA یا اسید آمینه ها. [ ۱]
برای ایجاد لوگوی دنباله DNA، RNA یا رشته پروتئین هایی که مکانهای اتصال محافظت شده مشترک دارند به ترتیب تراز می شوند به طوری که محافظت شده ترین مکانها یک تراز بندی خوب تشکیل می دهند. یک لوگوی دنباله سپس می تواند از ترازبندی چندگانه رشته های محافظت شده به وجود آید. لوگوی دنباله به خوبی نشان می دهد که در هر چقدر محافظت شده است: هرچه مقدار محافظت در آن مکان بیشتر باشد ( تعداد تغییرات کمتر باشد ) ، حرف نشان دهنده هم بلند تر خواهد بود. اگر ساکنین آن مکان بسیار متفاوت باشند، اندازه حرف نشان دهنده هر ساکن نشان دهنده فراوانی آن ساکن در آن مکان می باشد.
مقدار اطلاعات ( بردار Y ) در مکان i به این صورت به دست می آید:
که H i مقدار غیر قطعی بودن در مکان i نشان می دهد
در اینجا f a , i یک نسبت فرکانسی از باز یا اسید آمینه a است در مکان i و e n یک تصحیح نمونه کوچک ( small - sample correction ) برای ترازبندی n حرف است.
ارتفاع حرف a در ستون i با معادله زیر به دست می آید: height = f a , i ∗ R i
یک تقریب برای تصحیح نمونه کوچک، e n ، به صورت زیر به دست می آید:
که s برابر با ۴ است برای نوکلئوتیدها و برابر با ۲۰ است برای اسید آمینه ها و n تعداد رشته هاست در ترازبندی.