سه گانه کاتالیزگر

سه گانه های کاتالیزگر در واقع یک ست از سه امینواسید در موقعیت های به خصوصی می باشد که که درون جایگاه فعال برخی از آنزیمها قابل مشاهده است. [ ۱] این سه گاه های کاتالیزگر بیشتر در آنزیمهایی چون هیدرولازها و ترانسفرازها یافت می شوند. ( مثل پروتئاز، آمیداز، استراز، استیلاز و بتالاکتامازها ) . یک سه گانهی اسید - باز - نوکلئوفیل در واقع موتیفی معمول برای ایجاد ریشه نوکلئوفیلی در جهت کاتالیز کوالانسی است. ریشه ها تشکیل یک شبکه انتقال بار را برای قطبی نمودن و فعال کردن نوکلئوفیل ایجاد می کنند که به سوبسترا حمله کرده و تشکیل یک حدواسط کوالانسی را می دهد که پس از آن هیدرولیز شده تا دوباره آنزیم آزاد و محصول را ایجاد کند. آمینواسید نوکلئوفیل اکثراً به صورت معمول یک سرین یا سیستئین است ولی گاهی ترئونین یا حتی سلنوسیستئین نیز نقش نوکلئوفیلی را ایفا می کند. ساختار سه بعدی آنزیم این سه آمینو اسید را با چینش دقیقی در کنار هم قرار می دهد با اینکه از لحاظ فاصله در توالی آمینو اسیدی ( ساختار اولیه ) ممکن است چند صد یا چندین هزار باز از هم دور باشند. [ ۲]