روی هم چیدن (شیمی). در شیمی، انباشته شدن pi ( π–π stacking نامیده می شود ) به برهمکنش های احتمالی جذاب و غیرکووالانسی pi ( همپوشانی حلقه های معطر ( "برهم کنش ساندویچی" ) از نظر الکترواستاتیک باعث دافعه می شود. آنچه که بیشتر مشاهده می شود ( شکل سمت راست را ببینید ) یا یک برهمکنش انباشته ای ( جابجایی موازی ) یا برهمکنش pi ( عمود بر T شکل ) است که هر دو جذابیت الکترواستاتیکی دارند برای مثال، رایج ترین فعل و انفعالات مشاهده شده بین حلقه های معطر باقی مانده های اسید آمینه در پروتئین ها به صورت انباشته و به دنبال آن جهت عمودی است. جهت گیری ساندویچی نسبتا نادر است.
انباشتن pi دافعه است زیرا اتم های کربن با بارهای منفی جزئی از یک حلقه را روی سایر اتم های کربن با بار منفی جزئی از حلقه دوم و اتم های هیدروژن با بارهای مثبت جزئی را بر روی سایر اتم های هیدروژن قرار می دهد که به همین ترتیب بارهای مثبت جزئی را حمل می کنند. ] 1] در انباشته شدن به صورت پلکانی، یکی از دو حلقه آروماتیک به طرفین افست می شود به طوری که اتم های کربن با بار منفی جزئی در حلقه اول بالای اتم های هیدروژن با بار مثبت جزئی در حلقه دوم قرار می گیرند تا برهمکنش های الکترواستاتیکی جذاب شوند. به همین ترتیب، فعل و انفعالات Pi - teeing که در آن دو حلقه عمود بر یکدیگر قرار دارند، از نظر الکترواستاتیکی جذاب هستند زیرا اتم های هیدروژن با بار مثبت جزئی را در مجاورت اتم های کربن با بار نیمه منفی قرار می دهند. توضیح دیگر برای ترجیح انباشته شدن پلکانی به دلیل تعادل بین فعل و انفعالات واندروالس ( پراکندگی جذاب به اضافه دفع پائولی ) است.
این برهم کنش های انباشته ای و π - teeingبین حلقه های معطر در انباشته شدن هسته ای در مولکول های DNA و RNA، تا شدن پروتئین، سنتز الگو، علم مواد، و شناسایی مولکولی مهم هستند. با وجود استفاده گسترده از اصطلاح pi stacking در ادبیات علمی، هیچ توجیه نظری برای استفاده از آن وجود ندارد.
دایمر بنزن سیستم اولیه برای مطالعه انباشته شدن پی است و به طور تجربی با 8 - 12 کیلوژول در مول ( 2 - 3 کیلو کالری در مول ) در فاز گاز با جدایی 4. 96 Å بین مراکز جرم برای دایمر T شکل می باشد. انرژی اتصال اندک مطالعه تجربی دیمر بنزن را دشوار می کند و خود دایمر فقط در دماهای پایین پایدار است و مستعد خوشه شدن است.
شواهد دیگر علیه انباشته شدن پی از تعیین ساختار کریستالی اشعه ایکس می آید. در ساختارهای بلوری بسیاری از ترکیبات معطر ساده می توان تنظیمات موازی عمود بر هم و افست را مشاهده کرد. هندسه های موازی یا عمود بر افست مشابه در بررسی ساختارهای کریستالی پروتئین پرتو ایکس با وضوح بالا در بانک داده پروتئین مشاهده شد. تجزیه و تحلیل اسیدهای آمینه آروماتیک فنیل آلانین، تیروزین، هیستیدین و تریپتوفان نشان می دهد که دایمرهای این زنجیره های جانبی برهمکنش های تثبیت کننده زیادی در فواصل بزرگتر از میانگین شعاع واندروالس دارند.
این نوشته برگرفته از سایت ویکی پدیا می باشد، اگر نادرست یا توهین آمیز است، لطفا گزارش دهید: گزارش تخلفانباشتن pi دافعه است زیرا اتم های کربن با بارهای منفی جزئی از یک حلقه را روی سایر اتم های کربن با بار منفی جزئی از حلقه دوم و اتم های هیدروژن با بارهای مثبت جزئی را بر روی سایر اتم های هیدروژن قرار می دهد که به همین ترتیب بارهای مثبت جزئی را حمل می کنند. ] 1] در انباشته شدن به صورت پلکانی، یکی از دو حلقه آروماتیک به طرفین افست می شود به طوری که اتم های کربن با بار منفی جزئی در حلقه اول بالای اتم های هیدروژن با بار مثبت جزئی در حلقه دوم قرار می گیرند تا برهمکنش های الکترواستاتیکی جذاب شوند. به همین ترتیب، فعل و انفعالات Pi - teeing که در آن دو حلقه عمود بر یکدیگر قرار دارند، از نظر الکترواستاتیکی جذاب هستند زیرا اتم های هیدروژن با بار مثبت جزئی را در مجاورت اتم های کربن با بار نیمه منفی قرار می دهند. توضیح دیگر برای ترجیح انباشته شدن پلکانی به دلیل تعادل بین فعل و انفعالات واندروالس ( پراکندگی جذاب به اضافه دفع پائولی ) است.
این برهم کنش های انباشته ای و π - teeingبین حلقه های معطر در انباشته شدن هسته ای در مولکول های DNA و RNA، تا شدن پروتئین، سنتز الگو، علم مواد، و شناسایی مولکولی مهم هستند. با وجود استفاده گسترده از اصطلاح pi stacking در ادبیات علمی، هیچ توجیه نظری برای استفاده از آن وجود ندارد.
دایمر بنزن سیستم اولیه برای مطالعه انباشته شدن پی است و به طور تجربی با 8 - 12 کیلوژول در مول ( 2 - 3 کیلو کالری در مول ) در فاز گاز با جدایی 4. 96 Å بین مراکز جرم برای دایمر T شکل می باشد. انرژی اتصال اندک مطالعه تجربی دیمر بنزن را دشوار می کند و خود دایمر فقط در دماهای پایین پایدار است و مستعد خوشه شدن است.
شواهد دیگر علیه انباشته شدن پی از تعیین ساختار کریستالی اشعه ایکس می آید. در ساختارهای بلوری بسیاری از ترکیبات معطر ساده می توان تنظیمات موازی عمود بر هم و افست را مشاهده کرد. هندسه های موازی یا عمود بر افست مشابه در بررسی ساختارهای کریستالی پروتئین پرتو ایکس با وضوح بالا در بانک داده پروتئین مشاهده شد. تجزیه و تحلیل اسیدهای آمینه آروماتیک فنیل آلانین، تیروزین، هیستیدین و تریپتوفان نشان می دهد که دایمرهای این زنجیره های جانبی برهمکنش های تثبیت کننده زیادی در فواصل بزرگتر از میانگین شعاع واندروالس دارند.
wiki: روی هم چیدن (شیمی)