ترجمه اران ای

ترجمه آران ای. ترجمه یا برگردان آران ای[ ۱] فرایندی است که طی آن پیام های موجود در توالی نوکلئوتیدهای آران ای پیام رسان برای ساخت ترادف خطی اسیدهای آمینه استفاده می شود. دستگاه مسئول برگردان دارای چهار عضو اصلی است و شامل آران ای پیام رسان، آران ای ناقل، آنزیم آمینواسیل tRNA سنتتاز و ریبوزوم است. ناحیه ای از آران ای که رمز ساخت پروتئین را به همراه دارد، شامل توالی های سه نوکلئوتیدی به نام کدون یا رمزه[ ۱] است. رمزه ها در ترتیب قرارگیری آمینو اسیدها نقش عمده ای دارند. توالی قابل خواندن آران ای که دارای کد آغاز در ابتدا و کد پایان در انتهاست، قاب خواندن باز نامیده می شود.
برگردان در پیش هسته ها[ ۲] دارای سه مرحله است:
آغاز:.
در بالادست ناحیه قاب خواندن باز توالی کوتاهی به نام «شاین دالگارنو» وجود دارد که جایگاه اتصال بخش ۱۶S ریبوزوم است. توالی این بخش ریبوزوم به صورت ۳ ۵CCUCCU است و نحوه اتصال به شکلی است که هنگام اتصال زیرواحد بزرگ به هم آرا، رمزه آغاز در جایگاه Pریبوزوم قرار گیرد. در این مرحله فاکتورهای برگردان نقش عمده ای دارند به طوری که IF۱ مانع از اتصال رنای ناقل به ناحیه ای از زیرواحد کوچک می شود که بخشی از جایگاه A است. IF۲ یک GTPase است و با IF۱ و رنای ناقل آغازگر میان کنش می دهد و سبب تسهیل اتصال رنای آغازگر و مانع از اتصال سایر رناها به زیرواحد کوچک می شود. IF۳ به زیرواحد کوچک متصل می شود و مانع از اتصال دوباره آن به زیرواحد بزرگ می شود و با اتصال به ریبوزوم ۷۰S، کمک می کند تا زیرواحدهای کوچک و بزرگ خود تفکیک شود. با اتصال زیرواحد بزرگ به هم آرا، تغییر ساختمانی در زیرواحد کوچک اعمال می شود که سبب آزاد شدن IF۳ می شود. در غیاب این فاکتور زیرواحد بزرگ می تواند به زیرواحد کوچک متصل شود. این امر سبب تجزیه GTP توسط خاصیت GTPase فاکتور IF۲ می شود. ادامه:
در این مرحله آمینواسیل tRNAهای صحیح بر اساس رمزه موجود در جایگاه A وارد این جایگاه می شوند و سپس پیوند پپتیدی بین این اسید آمینه و اسید آمینه موجود در جایگاه A برقرار می شود. دو پروتئین کمکی که فاکتورهای طویل شدن نامیده می شوند، این فرایند را کنترل می کنند. آمینواسیل tRNA توسط EF - TU به ریبوزوم می آید. این فاکتور نیز به GTP متصل است و هر زمان که اسید آمینه در جای مناسب خود قرار گرفت، تجزیه می شود. در مرحله جابجایی، ریبوزوم به اندازه یک رمزه به جلو پیش می رود. کامل شدن این فرایند نیازمند عمل فاکتور طویل سازی دیگری به نام EF - G است. این فاکتور تنها موقعی وصل می شود که به GTP متصل باشد. پس از انجام واکنش پپتیدیل ترانسفرازی هیدرولیز این GTP سبب جابجایی رنای موجود در جایگاه A می شود. در مجموع این فرایندها باعث می شوند تا رنای ناقل موجود در جایگاه A به جایگاه P و نیز به جایگاه E منتقل شود.