بیوپرل

دانشنامه عمومی

بیوپرل[ ۱] [ ۲] مجموعه ای از افزونه های زبان برنامه نویسی پرل است که توسعهٔ اسکریپت های پرل را برای برنامه های بیوانفورماتیک را تسهیل می بخشد. این نقش مهمی در در پروژه ژنوم انسان بازی می کند. [ ۳]
بیوپرل یک پروژه نرم افزاری متن باز است که توسط بنیاد آزاد انفورماتیک پشتیبانی می شود. اولین مجموعه از کدهای پرل از بیوپرل توسط تیم هابرد و جونگ بک از شورای تحقیقاتی پزشکی مرکز کمبریج که در آن اولین تعیین توالی ژنوم توسط فرد سنجر انجام شد شکل گرفت. مرکز شورای تحقیقاتی پزشکی یکی از قطب ها و محل های تولد بیوانفورماتیک جدید است چنان که مقدار زیادی توالی DNA و ساختار سه بعدی پروتئین در آن جا دارد. نام بیوپرل به طور مشترک توسط جونگ بک و استیو برنر در اتاقی کوچک از مرکز مهندسی پروتئین ( CPE ) از مرکز شورای تحقیقات پزشکی ( MRC ) که مدیرش آلن فرشت بود ابداع شد. در آن اتاق کوچک، سایرس چوتیا و تیم هابرد با تعدادی از دانشجویان دکترا و همکارانشان کار می کردند. تیم هابرد متخصص برنامه نوسی پرل است و از th_llib. pl که که شامل تعداد زیادی زیرروال برای بیوانفورماتیک است استفاده می کرد. جونگ بک، اولین دانشجوی دکترای تیم هابرد بود که jong_lib. pl را ساخت. جونگ دو کتابخانهٔ زیرروال پرل را در Boi. pl با هم ادغام کرد. یک روز در ۱۹۹۵، استیو برنر، یک دانشجوی دکترای سایرس چوتیا به آن اتاق سر زد و بر روی آنچه آنها کتابخانهٔ پرل می نامند بحث کردند که این بعد از مباحثهٔ طولانی ( چند ماه ) بر سر اینکه آیا پرل از سی بهتر است بود زیرا استیو برنر کتابخانهٔ سی برای بیوانفورماتیک مختص خودش را داشت. این دو دانشجوی دکترا بعد از گذشتن از نام هایی مانند پروتئین پرل، پروتوپرل، بیوپرل و غیره برای زیست شناسی بیوپرل نام کتابخانه پرل خالص را گذاشتند. استیو برنر در سال ۱۹۹۵ یک بخش بیوپرل در سیستم های هوشمند برای زیست شناسی مولکولی ( ISMB ) کمبریج را سازماندهی کرد اگرچه واقعاً اتفاق نیفتاد. بیوپرل در ماه های آینده کاربرانی شامل جورج فیولن که یک دوره آموزشی در آلمان را سازماندهی کرد داشت. همکاران و دانشجویان جورج بیوپرل را بیشتر دادند که این بعداً توسط افراد دیگری مانند استیو چرویتز که به طور فعال کدهایی به زبان پرل برای پایگاه داده ژنوم مخمرش توسعه می داد به هم متصل شد. توسعهٔ عمده هنگامی انجام شد که دانشجوی کمبریج دیگری به نام ایوان برنی بعد از مباحثهٔ طولانی دیگری بر سر اینکه آیا پرل در بیوانفورماتیک از سی بهتر است به این واگن پیوست و ایوان و افراد زیاد دیگری در توسعهٔ بیوپرل فعال بودند.
عکس بیوپرل
این نوشته برگرفته از سایت ویکی پدیا می باشد، اگر نادرست یا توهین آمیز است، لطفا گزارش دهید: گزارش تخلف

پیشنهاد کاربران